第23章基因组学.ppt
第二十三章,基因组学与医学 Genomics and Medicine,第 一 节 基 因 组 学 Genomics,基因组(genome) 泛指一个有生命体、病毒或细胞器的全部遗传物质;在真核生物,基因组是指一套染色体(单倍体)DNA。,一、基因组学概念及范畴,基因组学(genomics) 就是发展和应用DNA制图、测序新技术以及计算机程序,分析生命体(包括人类)全部基因组结构及功能。,,基因组学包括3个不同的亚领域 结构基因组学(structural genomics) 功能基因组学(functional genomics) 比较基因组学(comparative genomics),基因组学概念,二、结构基因组学,结构基因组学(structural genomics)是通过HGP的实施来完成的。 HGP的内容就是制作高分辨率的人类遗传图和物理图,最终完成人类和其它重要模式生物全部基因组DNA序列测定,因此HGP属于结构基因组学范畴。,(一)物理制图 (二)遗传制图 (三)基因组DNA序列测定 (四)创建计算机分析管理系统,HGP包括以下研究内容,HGP主要任务及内容,通过HGP获得的广泛基因组信息组成了结构基因组学的基本内容,是开展功能基因组学的研究的基础;同时为详尽研究每一个单基因遗传病提供“平台”,并将成为复杂的多基因遗传病研究的发端。,三、功能基因组学,完成一个生物体全部基因组测序后即进入后基因组测序阶段——详尽分析序列,描述基因组所有基因的功能,包括研究基因的表达及其调控模式,这就是功能基因组学(functional genomics)。,(一)鉴定DNA序列中的基因 (二)同源搜索设计基因功能 (三)实验性设计基因功能 (四)描述基因表达模式,主要具体内容包括以下方面,功能基因组学研究策略及主要内容,四、比较基因组学,比较基因组学(comparative genomics)涉及比较不同物种的整个基因组,以便深入理解每个基因组的功能和进化关系。,第 二 节 基因组学与医学关系,The Relation between Genomics and Medicine,一、基因病的概念,以基因组学为基础,从疾病和健康的角度考虑,人类疾病大多直接或间接地与基因相关,故有“基因病”概念产生。根据这一概念,人类疾病大致分为三类: (一)单基因病 (二)多基因病 (三)获得性基因病,二、疾病相关基因的鉴定,(一)检测人类基因变异或突变 (二)疾病时基因组差异表达分析 (三)染色体制图定位及疾病相关基因克隆,寡核苷酸杂交分析SNP和等位基因特异寡核苷酸杂交,,,,,目 录,DNA芯片检测的差异表达谱,三、基因组学与肿瘤病因学,四、基因组学与流行病病因学 五、基因组学与医学伦理、法律和社会问题,