保护碱基添加总结

酶切位点保护碱基表 6 切割率切割率% % 酶酶 Pvu I 寡核苷酸序列寡核苷酸序列 2 hr2 hr CCGATCGG ATCGATCGAT TCGCGATCGCGA 0 10 0 10 0 50 0 10 10 10 75 0 0 10 90 10 10 0 0 20 hr20 hr 0 25 10 10 0 90 0 50 75 25 75 10 10 50 90 90 90 50 50 Sac I Sac II Sal I CGAGCTCG GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA Sca I Sma I GAGTACTC AAAAGTACTTTT CCCGGG CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA Spe I GACTAGTC GGACTAGTCC CGGACTAGTCCG CTAGACTAGTCTAG 酶切位点保护碱基表酶切位点保护碱基表 2 2 关键词关键词：酶切位点保护碱基表 2 切割率切割率%% 酶酶 Not I 寡核苷酸序列寡核苷酸序列 2 hr2 hr TTGCGGCCGCAA ATTTGCGGCCGCTTTA AAATATGCGGCCGCTATAAA ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA 0 10 10 25 25 10 90 0 0 0 0 0 0 75 0 10 90 90 0 0 10 0 10 0 50 0 10 10 20 hr20 hr 0 10 10 90 90 90 90 0 25 90 0 25 50 90 0 10 90 90 0 0 25 10 10 0 90 0 50 75 Nsi I Pac I TGCATGCATGCA CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT TTAATTAA GTTAATTAAC CCTTAATTAAGG Pme I GTTTAAAC GGTTTAAACC GGGTTTAAACCC AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG Pst I GCTGCAGC TGCACTGCAGTGCA AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT Pvu I CCGATCGG ATCGATCGAT TCGCGATCGCGA Sac I Sac II Sal I CGAGCTCG GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCG G ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCG GAA Sca I GAGTACTC AAAAGTACTTTT 10 75 25 75 Sma I CCCGGG CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA 0 0 10 90 10 10 0 0 0 0 10 90 90 90 0 90 75 75 0 10 10 0 25 50 90 10 10 50 90 90 90 50 50 0 25 50 90 90 90 0 90 90 90 0 25 75 0 75 90 90 Spe I GACTAGTC GGACTAGTCC CGGACTAGTCCG CTAGACTAGTCTAG Sph I GGCATGCC CATGCATGCATG ACATGCATGCATGT Stu I AAGGCCTT GAAGGCCTTC AAAAGGCCTTTT Xba I CTCTAGAG GCTCTAGAGC TGCTCTAGAGCA CTAGTCTAGACTAG Xho I CCTCGAGG CCCTCGAGGG CCGCTCGAGCGG Xma I CCCCGGGG CCCCCGGGGG CCCCCCGGGGGG TCCCCCCGGGGGGA 酶 Acc I 寡核苷酸序列 GGTCGACC CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG CACATGTG CCACATGTGG CCCACATGTGGG GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA CGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG CAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA GGGT(A/T)ACCC AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT CATCGATG GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG GGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG GGGTACCC GGGGTACCCC CGGGGTACCCCG Afl III Asc I Ava I BamH I Bgl II BssH II BstE II BstX I Cla I EcoR I Hae III Hind III Kpn I 切割率% 2 hr20 hr 00 00 00 00 9090 9090 9090 9090 9090 5090 9090 9090 1025 9090 9090 00 7590 2590 00 00 5090 010 00 2550 2590 00 00 9090 5050 9090 9090 9090 9090 9090 9090 00 00 1075 00 9090 9090 Mlu I Nco I GACGCGTC CGACGCGTCG CCCATGGG CATGCCATGGCATG 0 25 0 50 0 50 0 75 PCRPCR 引物设计原则引物设计原则信息来源：本站原创更新时间：2004-12-21 0:44:00 PCR 引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段，使其能有效地扩增模板 DNA 序列。因此，引物的优劣直接关系到PCR 的特异性与成功与否。要设计引物首先要找到 DNA 序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构，就要避开它。如这一段不能形成二级结构，那就可以在这一区域设计引物。现在可以在这一保守区域里设计一对引物。一般引物长度为15~30 碱基，扩增片段长度为 100~600 碱基对。让我们先看看P1引物。一般引物序列中G+C含量一般为40%~60%。而且四种碱基的分布最好随机。不要有聚嘌呤或聚嘧啶存在。否则 P1 引物设计的就不合理。应重新寻找区域设