基因工程复习资料 精心整理
第一章 绪论 1.基因工程的定义:在体外对不同生物的遗传物质(基因)进行剪切、重组、连接,然后插入到载体分子中(细菌质粒、病毒或噬菌体DNA),转入微生物、植物或动物细胞内进行无性繁殖,并表达出基因产物。 2.基因工程理论上的三大发现和技术上的三大发现 3.基因工程的基本步骤 (1)目的基因的获取:从复杂的生物基因组中,经过酶切消化或PCR扩增等步骤,分离出带有目的基因的DNA片断。 (2)重组体的制备:将目的基因的DNA片断插入到能自我复制并带有选择性标记(抗菌素抗性)的载体分子上。 (3)重组体的转化:将重组体(载体)转入适当的受体细胞中。 (4)克隆鉴定:挑选转化成功的细胞克隆(含有目的基因)。 (5)目的基因表达:使导入寄主细胞的目的基因表达出我们所需要的基因产物。 4.基因工程的意义 (1)基因工程在农业生产中的应用:提高植物的光合作用率;提高豆科植物的固氮效率;转基因植物;转基因动物。 (2)基因工程在工业中的应用: 1)纤维素的开发利用:克隆各种参与纤维素降解的酶的基因,导入酿酒酵母,就可能利用廉价的纤维素来生产葡萄糖,发酵成酒。 2)酿酒工业:用外源基因改造酿酒酵母,产生优质的啤酒。或用酿酒酵母生产蛋白质等。 (3)基因工程在医药上的应用:用微生物生产药物; 用转基因植物或动物生产药物;设计高效高特异性的生物制剂--疫苗;制造新型疫苗;基因诊断;法医鉴定;基因治疗。 (4)基因工程在环境保护中的作用: 1)检测水污染:用重组细菌或转基因鱼等检测水污染 2)生物降解:用带有重组质粒的“超级菌”分解油(烷烃类)、有机农药污染。 (5)基因工程商业化的发展 第二章 基因工程主要技术原理 1.质粒和基因组DNA的提取方法与纯化步骤,主要试剂是什么 质粒的提取和纯化方法 最常用的为碱抽提法: 原理:闭合环状的质粒DNA,在变性后不会分离,复性快。染色体线性DNA和或有缺口的质粒DNA变性后双链分离,难以复性而形成缠绕的结构,与蛋白质-SDS复合物结合在一起,在离心的时候沉淀下去。 步骤:1)溶菌:溶液I(50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl,10mM EDTA,4-5mg/ml 溶菌酶) 2)破膜:溶液II(0.2N NaOH 1.0%SDS) 3)中和:溶液III(3M醋酸钠 pH4.8) 4)离心 5)转移:将上清转移到一个新的离心管中 6)抽提:酚-氯仿抽提,酚/氯仿/异戊醇—25/24/1 7)沉淀:用0.6倍体积的异戊醇或2倍体积的乙醇(可以加入1/10体积的3M醋酸铵辅助沉淀) 23 / 1 基因组DNA的提取纯化方法 (1) 细菌基因组DNA的制备 细胞裂解(10%SDS和蛋白酶K。SDS是阴离子型去垢剂(detergent),可以使细胞膜崩解。 )—>DNA纯化(CTAB(十六烷基三甲基溴化铵) 除去多糖,酚-氯仿-异戊醇除去蛋白。 )—>沉淀DNA(0.6倍体积的异丙醇或2倍乙醇(可以加入1/10体积的3M醋酸氨辅助沉淀)) (2) 哺乳动物细胞基因组DNA的抽提 组织粉碎(动物组织剪成小块,置液氮中冻结后研磨成细粉末;组织培养的细胞用胰酶消化 松散后直接使用。)—>细胞裂解(0.5%SDS和0.1mg/ml蛋白酶K。50℃温育。)—>沉淀DNA(用2倍体积的无水乙醇或0.6倍体积的异丙醇。(加入1/10体积的3M醋酸氨可以辅助沉淀)。) (3) 从植物组织中制备 DNA 组织粉碎(用液氮冷冻后研磨成细粉末。)—>细胞裂解(用2%CTAB/2-ME (十六烷基三甲基 溴化铵/2巯基乙醇)或1% SDS和蛋白酶K。 65 ℃温育。)—>沉淀DNA(用0.6倍体积的异丙醇(-20℃)。(可以加入1/10体积的3M醋酸氨辅助沉淀)) 2.DNA的定量和纯度测定方法 (1)紫外光谱法: DNA在260nm波长处有特异的紫外吸收峰,蛋白质在280nm波长处有特异的紫外吸收峰 ,对于纯DNA: OD260/OD280 =1.8,若低于1.8说明有蛋白质杂质 (2)琼脂糖凝胶电泳估计 溴化乙锭(EB)能插入DNA分子中。与已知浓度的DNA电泳带荧光强度对比,就可以估计出DNA含量。 3.琼脂糖凝胶电泳基本原理及应用 原理:将某种分子放到特定的电场中,它就会以一定的速度向适当的电极移动。某物质在电场作用下的迁移速度叫作电泳的速率,它与电场强度成正比,与该分子所携带的净电荷数成正比,而与分子的磨擦系数成反比(分子大小、极性、介质的粘度系数等)。在生理条件下,核酸分子中的磷酸基团是离子化的,所以,DNA和RNA实际上呈多聚阴离子状态(Polyanions)。将DNA、RNA放到电场中,它就会由负极→正极移动。相同分子量的DNA:闭合环状卷曲超螺旋迁移最快,线性分子次之,伸展开放开环状最慢。 琼脂糖凝胶电泳的应用:用于对DNA分子量的估计,DNA片段的分离和回收。 4.聚丙烯酰胺凝胶电泳 1111- ,-甲叉双丙烯酰胺(N聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺单体(Acrylamide)和交联剂NN,Nmethylene bisacrylamide)在催化剂的作用下聚合而成。引发剂:过硫酸铵,加速剂:TEMED。电泳过程中分子迁移的规律,小分子在前,大分子滞后。电泳凝胶相当于凝胶过滤中的一个带孔胶粒。凝胶浓度越大,空隙越小。电泳后的凝胶径考马斯亮篮染色、脱色后的凝胶照片。 5.核酸杂交原理、类型及应用 原理:核酸分子杂交技术是依据核酸分子碱基互补、变性和复性原理,用标记的已知序列的单链核酸片段(DNA或RNA)作为探针,与未知的核酸片段进行杂交, 形成异源性杂交分子,然后通过标记信号的检测,鉴定样本中是否存在与探针互补的靶序列DNA。包括:DNA-DNA杂交、DNA-RNA杂交及蛋白杂交等。 特点:特异性高;灵敏度高;定位准确 应用:基因克隆的筛选;酶切图谱制作;基因组中特定基因序列的定量和定性检测; 基因表达的分析;基因突变分析;疾病的诊断、微生物病原体检测。 变性:在某些理化因素的作用下,核酸双链分子碱基对的氢键断裂,疏水作用被破坏,双链螺旋或发夹结构被拆开,有规则的空间结构被破坏,形成单链分子,称为核酸的变性。 23 / 2 ,此时melting temperature,Tm)1/2时的温度称为解链温度或熔解温度(A260值达到最大值 C含量有关。Tm与核酸的G、50%的DNA分子发生了变性。0.41+69.3 %×(G+C)Tm= Tm也受介质中离子强度的影响,离子强度低,熔解温度也低。 DNA的两条互补单链重新结合,形成双链的过程称为复性。复性:在适当条件下,变性即可恢复双链螺旋℃时,变性的单链DNATm值低20-30在热变性后,当温度缓慢冷却至比 结构,这样的复性又称为退火。在杂交前可用封闭物将这预杂交:为了减少探针与广泛存在的非互补核酸的